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爱国世家
生于台湾省苗栗县，可以说是出生在一个爱国世家，其先祖为躲避战乱而从中原南迁到粤东，因不愿在入侵者面前苟且偷安而举族南迁。在长期颠沛流离的徙居生活中，他们不得不与险恶的自然环境作斗争，养成了刻苦耐劳的习惯和勇于开拓进取的精神，并且后代子孙牢记一条遗训：即先祖是因外族侵扰而辗转南迁，所有后代子孙，不论落籍何处，都应勤耕苦读，自立图强。到丘逢甲的曾祖父丘仕俊时，因耕地狭小，无以为生，所以偕同乡又漂洋过海，向台湾迁徙，这大概是清乾隆中叶时期。到丘逢甲这一代，丘家在台湾定居已有四代、近百年的历史了。
1864年（同治三年），丘逢甲就出生在这样一个具有浓厚爱国爱乡思想、生活上则保持清朴风尚的乡村塾师的家庭里，自幼受清朴刚正家风的熏陶和艰苦生活的磨炼，“幼负大志”，渴望报效国家民族。这一切对他日后的事业以及人生道路都产生了积极有益的影响。丘逢甲自幼天资聪颖，读书过目不忘，在其父的亲自教授下，六七岁即能吟读、属对。14岁时赴台南应童子试，获全台第一，受福建巡抚兼学台丁日昌注意，连称“奇童”[6]，特赠“东宁才子”印一方，由此闻名全台。1887年（光绪十三年），入台湾兵备道唐景崧幕府，帖拜唐为师，对台湾风雨飘摇的局势有了更深刻的体会。[6]1888年（光绪十四年）参加乡试，中试为举人。
1889年（光绪十五年）春，赴京参加会试进士，中进士，钦点工部虞衡司主事。此时丘逢甲年仅26岁，但他却无意仕途，辞归故乡，专意养士讲学，任台南崇文书院主讲，同时兼任台湾府衡文书院及嘉义罗山书院主讲。1892年（光绪十八年），《台湾通志》总局正式开设，丘逢甲被聘为采访师，负责采访、补辑乡土故实，因此有较多机会深入民间，了解社会民情。这时期，整个中华民族正处在深刻的民族危机和社会矛盾之中，西方列强的殖民侵略使中华民族面临着生死存亡的威胁，这样的社会现实不能不使丘逢甲感到郁闷和隐忧，他慨叹道：“风月有天难补恨，江山无地可埋愁。”“孤岛十年民力尽，边疆千里将材难。”他预感到一场大的动荡即将到来，自己虽隐身山林，专心教读，但渴求报效国家之情却炽热而强烈。在他的书屋中，自书中堂“且看鹰翅出云时”，以明心志，时刻准备报效国家。
台湾战役
1894年（光绪二十年），中日甲午战争爆发，他预见到台湾前途危难，以“抗倭守土”为号召创办义军，自己带头变卖家产以充军费，并动员亲属入伍。不久，160营（实际上经训练的只有30余营）义军成立，丘逢甲担任全台义军统领（又称义军大将军）。
1895年（光绪二十一年）4月17日，李鸿章与日本首相伊藤博文在日本国马关春帆楼签订了丧权辱国的《马关条约》，激起了全国人民的义愤。丘逢甲悲愤交加，当即刺血上书，抗议李鸿章的卖国行径。刺指血书“拒倭守土”四字，率全台绅民上书反对割台，表示要与桑梓之地共存亡，清廷不纳。丘逢甲见无可挽回，遂倡议台湾自立为民主之国，率台民领衔电奏十六字：“台湾士民，义不臣倭。愿为岛国，永戴圣清。”亲草宪法，以蓝地黄虎为国旗，“永清”为年号。5月25日，建“台湾民主国”，拥署台湾巡抚唐景崧为总统。[6]此后他多次联合台湾绅士向朝廷发出呼吁电，要求废约抗战。清政府不但置台湾领土和几百万同胞于不顾，而且急诏撤回守土官兵。丘逢甲联合一批爱国志士，与日军展开抗战。日本侵略军进攻台湾后，台北、台南和台中的防务分别由唐景崧、刘永福和丘逢甲、林朝栋负责。由于唐平时放纵部下，纪律松散，无心抗战，一与日军交手，便节节败退，不久基隆失守，唐化装逃离台北，台北被日军轻易占领。消息传来，丘逢甲急举义军赴台北增援，途中得知台北已沦陷，唐已内渡，气愤至极。日军沿铁路南侵直达新竹，丘逢甲率义军与日本侵略军血战20余昼夜，进行了大小20多场战斗，给日军以沉重打击。终因“饷尽弹尽，死伤过重”而撤退。许多义军将领同时也是丘逢甲的弟子，如姜绍祖（“敢”字营统领）、丘国霖（“诚”字营统领）、徐骧（“捷”字营统领）、吴汤光等，都英勇献身。
同年秋，失败后离台内渡，定居镇平，往来潮、汕、广州之间，一度赴港、澳、南洋等地，曾与康有为、梁启超会晤。7月27日抵泉州。七月回祖籍镇平定居。为表示不忘光复台湾素志，为其子丘琮定别号“念台”，将房舍定为“念台精舍”。[6]后顺应时代潮流，从赞同维新保皇逐渐倾向革命，掩护同盟会员的反清活动，致力于兴办学校，推行新学，培植人才。先后担任两广学务处视学、广东教育总会会长、广东咨议局副议长等。民国成立，以广东代表身份赴南京参加筹组临时政府，被推举为参议院议员。
1912年（光绪二十八年）初，扶病南归，随即病故。他临终弥留之际，嘱咐家人：“葬须南向，吾不忘台湾也！”
黄冈起义
1904年（光绪三十年），丘逢甲在箭竹顶茶场策划“黄冈起义”行动计划期间，为石马私塾先生黄彩平题写的屋名“迁善楼”墨宝，因刻石师父不小心泡了水，缺损了一角，这次子渊公又在箭竹顶茶园议事厅请丘逢甲即兴挥毫重写了一张。为此，黄彩平还特地减免了何家两斗谷种的地租以表谢意。（迁善楼，光绪戊申夏月，丘逢甲书）
黄冈起义虽然失败了，但它给满清王朝所造成的冲击却堪与广州黄花岗起义相媲美。正如孙中山在他的《建国方略》中所言：“若无此次诸烈士轰轰烈烈足丧满虏之胆之善因，怎有辛亥武昌之义师一举而鄂督瑞澄入军舰之美果？”。
1904年（光绪三十年）春节，丘逢甲在箭竹顶茶场一共住了两晚，直至正月十八才下山。期间，特地以何子渊的字“东汉”为据，为子渊先生题下“光汉茶庄”和“渊庐”“顺裕庐”等多幅墨宝。
1907年（光绪三十三年）5月，第二次黄冈起义失败后，何子渊等领导人随即返回梅州。不久，萧惠长、江柏坚、姚竹英、张花谷等人身份不幸暴露，被迫走避箭竹顶茶场达半年有余。其中姚竹英等人在箭竹顶茶场住了半年多，萧惠长、江柏坚住了四个多月，邱逢甲为了营救革命党人及商量下一步行动方案，于1908年（戊申年）夏初，多次来到石马“顺裕庐”跟子渊先生商讨对策，后遇险党人卒在何子渊、丘逢甲的疏通、担保之下得以脱险。
教育事业
1897年（光绪二十三年）任潮州韩山书院山长，后又在潮阳东山书院、澄海景韩书院任主讲。1899年（光绪二十五年）创办潮州“同文书院”。翌年由广东当局派赴南洋调查侨情，历游越南、新加坡、马来亚、荷属东印度，向侨胞筹募办学经费。
1901年（光绪二十七年），迁同文书院于汕头，改为岭东同文学堂，自任监督（校长），开设格致、化学、生理卫生、经学、史学、算学等课程，聘清日本学者熊泽担任日文教学。同文学堂是广东第一所新式学堂，广泛传播了西方文明和改革思潮，培养学生千余人，后来大多参加了同盟会。此外，他还创办了镇平初级师范传习所、镇平县立中学堂。同年2月12日，广州新军起义，旋败。当局查知谘议局人员参与策划者有陈炯明、邹鲁，持名单见丘，要拘捕二人，经他力保始无事。同年，与陈炯明在谘议局力倡禁赌，为受赌商贿赂的部分议员所否决，遂发动社会大众展开斗争，卒使广东当局下禁赌令。
光绪三十二年（1906年）改任广州府中学堂监督，嗣又任广东教育总会会长。1909年9月当选广东谘议局议员，继又被举为副议长。同年受聘为两广总督公署议绅及两广方言学堂监督，与陈炯明等同盟会骨干时相往还，同情革命。时同盟会正筹划广州新军起义，计划成功后由丘逢甲、陈炯明分任正、副民政长官。
1911年9月，广东光复，丘任广东军政府教育部长。十月代表广东赴南京出席独立各省组建临时政府会议。
1912年1月，因肺病转剧南返，至潮州，接到被推举为临时参议院参议员之电。2月25日，病逝于镇平。
文学创作
丘逢甲少有诗名，内渡前所作已多，但代表其诗歌思想、艺术成就的，是内渡后的作品。这部分诗约1700多首，以怀念台湾和感愤时事之作最为突出。《山村即目》、《秋怀》、《纪梦二首》、《百字令》、《竹枝词》、《离台诗》、《天涯》、《元夕无月》《愁云》、《春愁》[9]、《往事》、《送颂臣之台湾》、《夏夜与季平肖氏台听涛追话旧事作》和前后《秋怀》等，倾诉台湾沦亡的悲愤，抒写思念故园的愁情和恢复失土的壮志。《香港书感》、《海军衙门歌》、《闻胶州事书感》、《汕头海关歌》、《答敬南见赠次原韵》（其三）等，揭露帝国主义对中国的瓜分和掠夺，谴责清政府的昏聩无能，要求变革图强，“诛秦”除暴。这些诗都具有鲜明的时代内容，体现了丘逢甲“重开诗史作雄谈”（《论诗次铁庐韵》）的创作特点。
此外，他的怀古、纪游诗，表彰前贤，刻画山川，往往寄托了忧时济世的怀抱。在艺术风格上，抒怀感时之作悲凉激越，写景小诗清新爽秀，叙事之作酣畅淋漓。在形式上,颇为放恣，不为格律所拘，语言圆熟流畅，好用俗语新词。所作以七律、七绝及七古居多。在风格卑靡、崇尚拟古的晚清诗坛上，丘逢甲的爱国诗篇，气壮而志奋、情真而意切，“震动一时”（江瑔《丘仓海传》）。梁启超称他为“诗界革命之巨子”（《饮冰室诗话》），黄遵宪说“此君诗真天下健者也”（《与梁启超书》）。唯其诗骋笔而书，不免有题意乃至语言雷同的缺陷，表现上也较率直而少含蓄。梁启超的《饮冰室诗话》中对这种豪放激越、震撼人心的诗风同样有很高的评价，并称丘逢甲为“诗界革命一巨子”。
诗集主要有《柏庄诗草》、《岭云海日楼诗钞》等。《柏庄诗草》为内渡前作品，作者原以为毁于战火，后人亦长期未见。1979年始被发现，今由丘氏后人收藏，有手稿影印本传世。《岭云海日楼诗钞》12卷，为其弟丘瑞甲从遗稿选辑编年，均为内渡后所作，1913年粤东编译公司刊印。1936年中山大学出版《诗钞》13卷本，系将原书第5卷“己亥稿上、下”分为2卷，又另辑“选外集”1卷。1982年上海古籍出版社的标点本，即以此为底本。1984年安徽人民出版社出版的《岭云海日楼抄》12卷，附《选外集》、《选外集补遗》、《柏庄诗草》、《其他诗作》，为现行丘诗的最足本。此外，1935年商务印书馆出版的《仓海先生丘公逢甲诗选》，是丘逢甲之子丘琮据《诗钞》12卷本所选，增入《离台诗》等作品。
潮汕新学
丘逢甲虽然在潮汕地区任教的时间不长，但他扬弃旧式以时务、策论、诗、古文辞课士，摒弃八股试帖，创办当时粤东潮属各县独一无二的新式学堂，开创了潮汕近代新学的先声。
撰题联
松寿千岁；
桂馨一山。
——丘逢甲题以其父命名的书屋潜斋
培栽后进；
远继先芬。
——丘逢甲题广东省蕉岭淡定树培远堂
陆沉欲借舟权住；
天问翻无壁受呵。
——丘逢甲自题广东省梅县黄遵宪人境庐无壁楼
慈爱在人间，屹鸟闽花常被泽；
济施满天下，梯山航海尽沾恩。
——丘逢甲题台湾省台中丰原慈济宫
凭栏望韩夫子祠，如此江山，已让前贤留姓氏；
把酒吊马将军庙，奈何天地，竞将残局付英雄。
——丘逢甲题广东省潮州韩山书院
西枕庐峰，东朝玉笔，山水本多情，耕读渔樵俱适意；
南腾天马，北渡仙桥，林泉皆胜境，用藏书处尽随心。
——丘逢甲自题广东省蕉岭丘宅心泰平草庐
西北揭阳岭，东南太平洋，此楼萃山海奇观，望远登高，顿生八表经营志；
剌史韩昌黎，衙官赵天水，所学得圣贤宗旨，读书论世，莫负千秋尚友心。
——丘逢甲题广东省潮州金山书院藏书楼
此山界闽粤之交，自成丘壑，任仙人灶冷，帝子岩寒，群峰拱揖尚依然，看残世界空华，万柄青莲，九品台高开宝座；
我佛以慈悲为本，何惜津梁，仗西竺经遗，南宋钵在，末劫挽回原易事，留得英雄退步，一庵黄叶，三生石上证清禅。
——丘逢甲题广东省大埔县西北阴那山祥光寺
赠诗
赠潮阳三生歌
有子朱子开闽学，潮人从者郑与郭。宗风歇绝七百年，觉时谁振南天铎。
我从闽来见二生，潮中人材犹不弱。郑生步月昨过我，手持东山松石歌。
侵晨剥啄者谁子，郭生入坐庄而和。有闽谁辟八使九，陈将军者实功首。
贵人之山奇气尚郁盘，恨我迟来不见豪士陈龙友。
其人悲歌慷慨能谈兵而使酒，何意乃有高足生，循循继其后，为师立传冀不朽。
郑生昨告我以陈生之才，今闻郭生语亦同，令我日望足音跫然来。
东山之高高出青云上，贞松奇石郁相望。何时三生同题石上名，酾尊补祝文丞相。
——赠潮阳三生陈秀升、郭经、郑浩
