医院以保存牙齿(牙体牙髓病、牙周病的诊治和种植牙),恢复功能和美观(全瓷牙、烤瓷牙、瓷贴面、贵金属牙套、纯钛铸造义齿、磁性义齿和隐形义齿),矫治儿童和成人牙列不齐(正畸治疗),口腔颌面部创伤、肿瘤、先天性或后天性(获得性)畸形的手术治疗为主干业务,开设了一系列专科,如三叉神经痛、颞下颌关节病、心电监护拔牙、口腔粘膜病、儿童齿科、洁牙、耳鼻喉科、睡眠呼吸疾病的诊断和治疗、齿科美容及医学(激光)整形美容等特色门诊。
近3年获国家、省、市科技进步奖10余项,年发表论文80余篇。
医院科室齐全,设有口腔内科、口腔颌面外科。腔修复科、口腔正畸科、口腔预防科、整形美容科等临床科室13个、医技科室7个、临床教研室4个和中心实验室2个,其中口腔颌面外科是江苏省135重点学科建设单位、江苏省临床重点专科,口腔修复科、口腔内科则为南京市重点专科。
医院在职职工470人,其中高级技术职称60余人,有12名专家分别担全国中华口腔医学会各专业委员会委员;2位专家是江苏省135重点人才;6位专家是“江苏省333重点人才培养工程”对象;14位专家是南京市213重点人才培养对象;4位专家是南京市中青年行业技术学科带头人。
设病床100余张,口腔综合治疗台200张,年门诊量45万余人次。
1947.3.1成立中央卫生实验院牙病防治所,隶属于国民政府中央卫生实验院
1949.3.16中央卫生实验院牙病防治所划入南京市立医院,为该院牙科
1952.12.1南京市立牙症防治所
1958.5.1更名为南京市口腔病防治院
1984.7.21更名为南京市口腔病医院
1986.11.19更名为南京市口腔医院。隶属于南京市卫生局,系全民所有制事业