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医疗是国家临床重点专科建设单位。2018年医院门诊量85.2万人次，开展手术近6万例。医院专科齐全，目前共设19个临床亚专科及6个临床诊疗中心，其中视光学专科、眼鼻相关专科、屈光手术专科、角膜病专科等在国内乃至国际都有着较大的影响力。医院积极响应新医改要求，创新性地推出眼全科门诊、疑难眼病联合门诊、名医专家团队诊疗模式等，给群众提供更加安全、高效、便捷的医疗服务。牵头组建全国眼视光联盟，首批加入了18个省市、自治区近2000家单位；启动眼视光远程诊疗平台，建立服务基层和西部地区远程转诊服务；牵头组建浙江省眼视光专科联盟和医疗联合体，吸纳联盟单位69家、医联体单位3家。在临床诊断、远程医疗、学科共建等方面开展全面合作，全力推进眼视光医疗事业发展。创新“中国眼谷——温州眼视光国际创新综合体”模式，推进眼视光产业生态建设、产业升级和区位聚集，打造眼健康领域“硅谷”，目前有11家企业入驻。2009年获评全国医药卫生系统先进集体。
医院位列中国医学科学院的“2018年中国医院科技量值（原中国医院科技影响力评价排行榜）”科技产出位居全国眼科第一，综合排名全国眼科前二。在2018年自然指数（NatureIndex）排行榜中，继续位居全国医疗机构眼科第一，在全国所有医院的生命科学大类文章中居第14位。作为目前国内规模最大、层次最高、最早开展视觉科学研究的机构之一，发明的对数视力表获得1978年全国科学大会奖，并被确定为国家强制性标准（GB-11533-89）。目前拥有国家临床医学研究中心（已公示）、国家重点实验室、国家工程技术研究中心、教育部眼视光行业产业省部共建协同创新中心、科技部再生医学与神经遗传国际联合研究中心、教育部近视防控与诊治工程研究中心、国家卫生健康委视光学研究中心、国家卫生健康委视觉科学研究重点实验室、国家药物临床试验中心等国家省部级平台。获国家重点研发项目、“973”项目（首席科学家单位）、“863”课题、科技部国际合作项目、卫生部卫生行业专项、国家自然科学基金重点项目等；荣获国家科学进步二等奖2项，中华医学科技奖一等奖1项，中国产学研合作创新成果奖1项，何梁何利科学与技术进步奖1项，谈家桢生命科学奖临床医学奖1项，浙江省科技进步一等奖4项，浙江省自然科学一等奖1项等重大科研成果奖。《EyeandVision》英文期刊入选SCIE数据库。
医院获国家科技重大专项支持，建有“眼视光GCP研究平台”。积极开展与临床、社会发展密切相关的科技研究和成果转化，自主创新研制“准分子激光屈光治疗设备”等科技产品获CFDA产品注册证书，关键指标居国际领先。8项眼视光医疗器械科技成果转化项目入选2016年国家科技计划重点科技成果转化推广名单。共建共管的中科院温州生物材料与工程研究所，已逐步成为温州市产业转型升级的重要技术平台和人才高地。
屈光手术、白内障和角膜病、眼底病科（含眼底外科和眼底内科）和眼外伤、青光眼、小儿眼科、斜视弱视、眼眶眼肿瘤、眼鼻相关等临床专科。
医院积极引进和培养高层次人才，“眼科精准医疗创新引智基地”“生物材料与临床转化学科创新引智基地”入选地方高校“高等学校学科创新引智计划”，团队入选教育部“长江学者和创新团队发展计划”等。14人次入选中华医学会眼科学分会学组组长或组员，是国内入选中华眼科学会学组成员最多、涉及组别最广的眼科专科医院。科技创新领军人才3人、青年拔尖人才1人，科技部中青年科技创新领军人才2人，卫生部有突出贡献中青年专家2人，教育部跨世纪优秀人才支持计划3人，国务院特殊津贴人员3人，国家自然科学基金优青获得者2人等国家级、省部级各类人才项目120余人次。
