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1999年5月，开始主持河北电视台的全新娱乐栏目《激情九九》。
2002年主持河北电视台王牌综艺节目《国人猜猜猜》。
2003年，主持了最后一期《激情九九》。到中国传媒大学进修影视编导专业，主持生涯也跃上了一个新的高度——在央视客串主持《选择》和《童言无忌》栏目。在主持中央电视台科教频道《选择》栏目并兼任该栏目主编期间，被评为2004年度CCTV青少年中心先进个人。获得第十一届“中国青年五四奖章”。
2005年2月，重回河北电视台，同年，转而主持央视《三星智力快车》栏目。
2006年4月以后，方琼和“魅力新搭档”新秀尼格买提共同主持央视《全家总动员》栏目。同时，还在央视《三人餐桌》和《超市大赢家》亮相，横跨央视少儿频道、经济频道、科教频道。现已成为中央电视台主持人，主持CCTV-2《超市大赢家》、《全家总动员》和CCTV-少儿《三星智力快车》。
2007年12月登入央视名嘴挂历。
2008年入选“中国奥运报道主持人国家队”，担任奥运频道《荣誉殿堂》栏目主持人。2008年8月，与程成、刘刚共同主持河北卫视大型综艺节目《综艺传奇》。2008年主持河北卫视《家政女皇》。
2010年2月起至2010年6月，主持湖南卫视《百科全说》。2011年主持《综艺大登殿》。
2013年1月与主持河北经视《我为购物狂》。2013年与大左主持《加油！少年派》。2013年与毕福剑主持《越战越勇》。2013年主持央视少儿频道《智力快车》。2013年10月被聘河北大学艺术学院影视艺术系研究生导师。
2014年4月，主持河北经视《大兵小将》
2016年，担任越战越勇评委；同年8月，方琼的个人公众号上线。
2016主播爱上广场舞
2016越战越勇
2016寻找新主播
2015总裁私房菜
2015数字宾果王
2014大兵小将
2013非童小可
2013我为购物狂
2013加油！少年派
2013炫动中国风
2012挑战九宫格
2011综艺大登殿
2010梨园闯关我挂帅
2010家有父母
2009家政女皇
2008综艺传奇
2007快乐方程式
2007奥运小冠军
2006绿野寻踪
2006美食美客-三人餐桌
2006超市大赢家
2006全家总动员
2005三星智力快车
2005激情久久
2004童言无忌
2001勇者胜
2000第一次的亲密接触
1999激情99
2006年10月15日，由共青团石家庄市委、石家庄希望工程办公室主办的“爱心放飞希望”大型公益活动在省会法制公园广场顺利举行。被聘为石市首位希望工程形象大使的主持人方琼现场义卖《河北青年报》，为希望工程募集善款。活动中，团市委书记董晓航为方琼颁发了聘书、绶带和形象大使图册。方琼说能成为石市首位希望工程形象大使感到很荣幸，希望通过自己的影响力，把这份爱心传递得更远更广。在现场，方琼还为市民献上了她从一所希望小学的孩子们那里学的一首歌。幽默的方琼还以此为交换条件，说她唱歌后，义卖的《河北青年报》将涨价一倍，升为一元一份，并希望大家踊跃购买献出自己的爱心。所得善款将全部捐给希望工程。
2010年4月21日，央视举行了“情系玉树大爱无疆——抗震救灾大型募捐活动特别节目”，共募集捐款21.75亿元，方琼为灾区捐款1万元。
2013年1月19日，在北国商城门前广场举行了联想电视入驻北国电器北国总店的入驻仪式，在活动现场，北国电器联手联想电视共同邀请了央视著名主持人方琼，现场为联想电视的入驻助阵，并现场向邯郸的“爱心妈妈”捐赠了两台联想智能电视。
2014年11月，河北慈善联合基金会、中国经济网河北频道发起，“真爱护航”青少年关爱计划--暨“关爱困境儿童·我们在行动”大型公益活动。由著名导演和方琼等各大主持人鼎力相助的微电影《楼顶》也即将上映，为关爱留守儿童。
方琼，她曾经身披橄榄绿，体会过多姿多彩的军旅生活；也曾经饱含爱心，从事幼教工作；她还曾步入社会，做过广告人。无论是哪一个阶段，方琼都尽心尽职，得心应手。（中国网评）
丰富的人生经历为方琼的成长积累了厚实的社会知识，也造就了她待人接物的亲和力、机敏的反应能力、出口成章的语言表达能力。为了自己的职业梦想，她不断充实自我，潜心学习，很快成为人们颇为喜爱的主持人。（人民网评）
