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吉林长白山灵芝地理标志地理保护范围为北纬41°21′至44°30′，东经125°17′至131°18′；南起集安市、北至舒兰市，西起东丰县、东至珲春市。涉及白山市、通化市、吉林市、延边州和辽源市的15个县（市、区）的29个乡镇。
赤芝：菌盖近圆形、肾型或马蹄形，表面黄褐色至红色，幼嫩时边缘呈黄色，有环带和同心辐射皱纹，有漆样光泽，边缘锐或稍钝稍向内卷。菌肉淡白色或木色，菌管褐色或浅褐色，菌盖底部呈淡黄色或金黄色，气微、味苦。菌柄短肉厚，近圆柱形，侧生、偏生或近中生，与菌盖同色，有光泽，菌体比重大。
紫芝：菌盖半圆形、近圆形或近匙形，表面紫黑色、近黑色或紫褐色，有似漆样光泽，有明显或不明显的环带或纵皱，边缘薄或近似截形，与中间同色或较淡。菌肉均匀褐色或深褐色，菌管深褐色或灰褐色，孔面污白色或深褐色，管口略呈圆形。菌柄侧生、背侧生或偏生，圆柱形或略扁平，与菌盖同色或更深，有光泽。
松杉灵芝：菌盖肾形、半圆形或近扇形，表面红褐色或污红褐色，有似漆样光泽，无环带或具不明显环带。菌肉白色或淡白色，接近菌管处呈淡褐色。菌管淡黄褐色或颜色较深，孔面初淡白色，后渐变成与菌管同色，管口圆形。菌柄粗而短，紫黑色，有较强的光泽。
吉林长白山灵芝符合《中国药典》（2015年版）中的指标，即水分含量不超过17.0%，粗多糖含量在0.9%以上，三萜类含量在0.5%以上。另外，吉林长白山灵芝干品中，100克灵芝钙含量在71毫克以上，镁含量在79毫克以上，铁含量在13毫克以上。吉林长白山灵芝中所含的抑制肿瘤的灵芝三萜类灵芝酸、增强人体免疫力的灵芝多糖以及灵芝腺苷的含量高。
长白山区域内幅员辽阔，域内土壤类型包括19个土类，44个亚类，主要以黑钙土、白浆土、黑土、新积土和水稻土为主。东部山区、半山区的针阔混交林下具有棕色层的酸性淋溶土壤，主要分布在白山市、通化市、吉林市、延边州，土壤腐殖质层厚度20厘米左右，有不明显的浅色亚表层，沉积层多呈黄棕色，黑土有深厚的、逐渐过度的暗色腐殖质层，腐殖质含量高，土壤呈粒状或团状结构，呈中性或微酸性，通体无石灰性反应，适宜优质吉林长白山灵芝生产。
长白山区域内国际A级自然保护区——长白山自然保护区，多为原始森林，长白山森林生态系统是亚洲东部保存最为完好的典型森林生态系统，生态系统年固碳约2.11×107吨，另外它还是重要的物种基因库，区域内的森林资源和物种资源为灵芝栽培提供优越的条件。
长白山与欧洲阿尔卑斯、俄罗斯高加索并列为世界三大黄金水源地，又是鸭绿江、松花江、图们江三大水系的发源地，延边地区主要为图们江水系，包括布尔哈通河、嘎呀河、海兰江和珲春河等；东南部鸭绿江水系，浑江流经白山和通化；其余均为松花江水系，支流有辉发河、伊通河、牡丹江，拉林河、饮马河等。三大水系组成了中国东北地区的水网，全年径流量达240亿立方米，水力蕴藏量347万千瓦。区域内矿泉水资源十分丰富，矿泉水日平均涌水量24万吨左右。长白山天然矿泉水属微碱性，水质天然、纯净、无污染，含有较多的偏硅酸、锂、锶、溴、钙、镁、锌、硒、碘等有益矿质营养元素，对人体确有较明显的营养保健作用，国际权威组织认定为世界三大优质矿泉水产地之一。
长白山区域属寒温带大陆性季风气候，云雾多，风力大，气压低，是长白山区域的主要气候特点。夏热冬寒，日照少、气温低，昼夜温差在13℃以上，历年7月平均气温22℃，最低气温-35℃，最高气温36.5℃；1月份平均气温-13℃，年平均气温5.2℃；年平均降水量880毫米，雨水集中在7～8月份，占全年降雨量的72%；年平均蒸发量1200毫米，年平均相对湿度为80.8%，无霜期110天左右，平均日照时数为2259小时～3016小时；冻土深度1.5～2.0米。独特的气候使栽培的吉林长白山灵芝具有特殊的品质。
1.栽培模式
（1）大棚栽培：在1月1日至3月20日期间生产菌段；在5月10日至6月1日期间埋段扣棚出芝。
（2）林下栽培：在5月初至7月初间生产菌段；在9月至10月埋段，次年6月至9月出芝。
2.工艺流程
（1）木段栽培：选料→截段→扎捆→装袋→灭菌→接种→培养与后熟→埋段→出芝管理→采收
（2）代料栽培：配料→拌料→装袋→灭菌→接种→培养与后熟→埋袋→出芝管理→采收
3.栽培技术
（1）发菌场所与栽培场地
①菌段（袋）在室内或简易棚发菌，有加温和通风设施。
②大棚栽培：地势平坦，有水源、电源。
③林下栽培：选择坡度在30度以下的林地，郁闭度在0.6。
（2）原料准备
①木段栽培：选择桦、柞、槭和榆等阔叶树种的木段栽培赤芝与紫芝，选择松、杉针叶树种栽培松杉灵芝。根据接种时间确定砍伐时间，在树液流动之前3个月砍伐为佳。
②代料栽培：选择柞、桦、榆等阔叶树种的木屑，辅料选用当地生产的米糠，并添加1%石膏粉。
（3）栽培袋（段）制备
①代料栽培：采用拌料机拌料，培养料含水量58%～60%，然后机械装袋。
②木段栽培：在接种前3天～5天截段，将砍伐的树木剔去枝桠削平，截成12～15厘米长小段，长短一致，不留毛茬，截口和木段成直角。直径8厘米以上的段木在截面劈成2～4柈，用撕裂膜（低压乙烯或聚乙烯）扎捆，用相应规格的低压乙烯无害塑料袋将木段装袋。
（4）灭菌
菌段（袋）采用常压灭菌或高压灭菌，常压灭菌100℃持续10小时（菌袋）或20小时（菌段）。高压蒸汽灭菌121℃保持3小时～3.5小时。
（5）接种
接种操作方法要严格按照NY/T528《食用菌菌种生产技术规程》中要求执行。
（6）发菌管理
接种后20天内，发菌室温控制在25℃～28℃，20天后温度降至20℃～22℃；空气相对湿度控制在50%～60%之间；暗光培养，以看不清报纸为度；10天内不通风，待菌丝封面后及时通风，并逐渐加大通风量。
（7）脱袋埋段
①大棚栽培：栽培场地作畦，畦宽2.5米，畦长根据地形决定，畦间留30厘米～40厘米宽的作业道，畦间挖排水沟，并挖排水沟。先脱去菌木外塑料袋，将接种面朝上，菌木埋直，顶面高度一致，间距8厘米～10厘米。然后覆土厚度2厘米～3厘米。
②林下栽培：在郁闭度0.4～0.5的林下挖坑，坑的大小与菌段直径一致，将脱去塑料袋菌木放入坑内。菌段露出地面8-10厘米,并在菌段上覆山砂与苔藓。
（8）出芝管理
①大棚栽培：覆土后覆盖大棚膜，7天内不覆盖遮阳网，温度保持在24℃～28℃；7天后喷重水一次，覆土含水量50%～60%，空气相对湿度80%～90%，保持床面湿润，如菌木外露应及时补土。灵芝菌盖长到3厘米时开始着色，出芝棚内保持半阴、半阳的散射光。喷水增湿后要适当通风，以灵芝盖面无积水为宜。
②林下栽培：菌袋覆土后，定期拔杂草，采用诱杀法防虫。
产品收获以及生产记录要求
1.收获
当菌盖边缘白色生长圈完全消失，菌盖表面色泽一致呈赤红色不增大，菌管面呈淡黄色时就可采收。
2.生产记录
要求生产地点、菌种来源、栽培配方、接种时间、接种方法、消毒药剂使用、栽培模式、采摘管理、加工管理、贮藏管理、出入库台账、销售的日期、方式、数量等进行详细的记录，记录档案专人管理，为长白山灵芝生产管理技术体系和质量服务提供依据。
质量安全规定
生产中严格按照国家无公害农产品相关规定执行，环境应符合GB3095的要求，饮用水应符合GB5749-2006的要求；生产原料符合NY5099的要求，卫生指标符合GB2762-2017、GB2763-2016及LY/T1826的规定要求。
标志使用
使用吉林长白山灵芝地理标志的产品必须产自本区域范围，生产经营者必须取得登记产品相关的生产经营资质，生产经营者必须严格按照规定的质量技术规范组织开展生产经营活动。标志使用人应当自觉接受监督检查，保证地理标志灵芝产品的品质和信誉。标志使用人要正确规范地使用标志，统一采用吉林长白山灵芝名称和产品地理标志公共标识相结合的标注方法，标注的标签要符合GB7718和GB/T191规定。
贮藏与运输
不能与有异味、有毒的物品混合贮藏，贮藏库房内相对湿度不要超过60%。运输过程中防晒，防潮，严禁与有毒物品混装，严禁用含残毒、有污染的运输工具运载。
2018年，吉林长白山灵芝总生产规模为417公顷，产量2354吨。
2018年9月5日，中华人民共和国农业农村部正式批准对“吉林长白山灵芝”实施农产品地理标志登记保护。