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中国医学科学院血液病医院（血液学研究所）由中国血液学创始人邓家栋教授创建于1957年。七十年代迁往四川，1982年重新迁回天津。
90年代以来，随着我国血液学事业的发展和医疗市场的变化，中国医学科学院血液病医院不断开拓创新，谋求血液学事业的新发展。从容不从众，追求创新，精髓不变是我们的办院方针。为把医院做“特”，科研做“精”，我们改“大所小院”为“大院小所”，由过去二百张床位的“小综合”，发展为七百余张床位的血液病“大专科”，由过去一个大血液内科发展为按病种和功能设置的12个临床中心的专科医院；以实验血液学国家重点实验室为龙头，围绕实验血液学和干细胞研究凝炼研究方向，建立了精干的基础研究队伍。
中国医学科学院血液病医院是我国最大的集医疗、科研、教学、产业于一体的国家级科研型血液病专业医疗机构，国家血液系统疾病临床医学研究中心、实验血液学国家重点实验室、国家“一带一路”联合实验室依托单位，国家干细胞工程技术研究中心、细胞产品国家工程研究中心、国家干细胞工程产品产业化基地依托单位；内科学（血液病）、药物药理学、细胞分子生物学的全国重点学科点，国家药物临床试验机构，世界血友病联盟国家成员单位（中国）的执行部门，卫生部国家核事故医学应急中心临床一部，国家血友病病例信息管理中心的依托单位，中国医学科学院干细胞医学中心的依托单位。
中国医学科学院血液病医院紧密围绕基础与临床结合的特点，坚持“科学问题源于临床，科研成果服务患者”双轮驱动战略，对常见血液病特别是恶性血液病的基础研究、诊断治疗达国内领先、国际先进水平。作为全国唯一的血液病三级甲等专科医院，院所设有12个临床诊疗中心；以全国唯一的实验血液学国家重点实验室为依托，以干细胞研究为切入点，进行恶性血液病的病理基础的系统研究，建有五大开放性技术平台，与国内和国际多家著名研究机构保持横向合作。
中国医学科学院血液病医院一大批科研成果首创国内第一，不断填补我国血液学领域的空白。
建所初期，血细胞命名最早规范了我国血液学基础工作；至今被全国科研单位使用615小鼠是中国医学科学院血液病医院培育的第一个近交系纯种小鼠，由此建立的可移植性小鼠白血病模型L615在抗癌药物筛选和白血病发病研究中起到了重大作用；最早发现急性髓系白血病M2b，比国外早12年；最早展开了骨髓增生异常综合症（MDS）的研究，为白血病的早期诊断与及时治疗提供了科学的依据；最早发现了用中药治疗慢性粒细胞白血病的药物靛玉红，在国际上首创应用双吲哚类药物治疗肿瘤；最早提出了再障急慢性分型，并探索出中医和中西医结合治疗再生障碍性贫血的一系列治疗方案。此外，院所还对白血病，血友病、异常血红蛋白、β－地中海贫血等病种进行了一系列大规模的流调，摸清了疾病特点、分布情况、发病率，并发现了四种世界上新的异常血红蛋白和八种国内从未发现过的异常血红蛋白。对疾病的防治、优生学的开展、分子遗传学及人种学的研究具有十分重要的意义。
八十年代，中国医学科学院血液病医院成功进行了国内第一例自体骨髓移植，开辟了我国自体干细胞治疗的新领域。
新世纪以来，中国医学科学院血液病医院建立了我国特有的以高三尖杉酯碱、阿糖胞苷、柔红霉素为基础的联合强烈化疗方案，按照预后危险度分层治疗急性髓系白血病，疗效达国际先进水平，成为全国白血病治疗的领头羊；采用抗胸腺细胞球蛋白治疗重型再生障碍性贫血，有效率高达75%以上；在国内率先开展了大剂量环磷酰胺治疗重型再障的新方法，使初治患者获得70%疗效，使不少经费困难患者得到救治；采用分组的个体化治疗手段，使儿童血液病主要病种疗效达国际先进水平；根据WHO（2008）版诊断标准对淋巴组织肿瘤进行精确诊断，依据疾病预后分层进行规范化和个体化的整体治疗，使多发性骨髓瘤和淋巴瘤的治疗达国际水平，成为我国规模最大、水平最高的系统从事淋巴组织肿瘤临床诊治和研究的中心；采用HLA匹配同胞供者异基因造血干细胞移植、单倍体相合造血干细胞移植、无关供者造血干细胞移植治疗急、慢性白血病、重型再生障碍性贫血、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、骨髓增生异常综合征等恶性血液病患者，移植后长期无病生存率达到国际先进水平；提出了适合我国国情可在我国基层医院推广应用的一揽子MDS诊断、预后判断和分层治疗方案已在全国推广使用；院所承担着全国血友病病例信息管理工作，并作为中国血友病诊疗中心协作网的组长单位，负责组织实施了全国血友病的登记注册。此外，院所积极发挥引领作用，制定了我国血液病临床路径与诊疗规范。
自评选以来，中国医学科学院血液病医院连续九年荣获中国医院排行榜专科（血液科）排名第一，连续五年荣获中国医院科技影响力（血液病学）第一。
中国医学科学院血液病医院紧密围绕基础与临床结合的特点，走“科学问题源于临床，科研成果服务患者”之路，医疗对常见血液病特别是恶性血液病的诊断治疗达国内领先、国际先进水平；科研以全国唯一的实验血液学国家重点实验室为依托，以干细胞研究为切入点，进行恶性血液病的病理基础的系统研究。围绕这一方向，建有五大开放性技术平台，承担着“十三五”期间已经启动的血液学研究领域主要的重大科研项目，与全国和国际多家著名研究机构保持横向合作。
中国医学科学院血液病医院总占地面积3834.6平方米,总建筑面积58387.94平方米，业务用房面积50322.12平方米。现有职工1209人，拥有专业技术人员正高级职称61人、副高级职称113人、博士生导师35人、硕士生导师33人、长江学者特聘教授2人、卫生部中青年突出贡献转件6人、天津市“131”人才第一层人选6人、天津市授衔专家1人、CMB杰出教授1人、协和学者特聘教授6人。
