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2002年，黄雅琼8岁时就读于舟山路小学，开始追随曾入选羽毛球国青队的浙江省队退役运动员曹骥，接受系统的羽毛球训练。
2003年，9岁的黄雅琼被原浙江省体育运动学校看中，开始接受训练。
2011年，黄雅琼首次代表中国国家羽毛球队参加亚洲青年羽毛球锦标赛，在小组赛中黄雅琼、于小含以2-0战胜叙利亚选手AljaladTAGRED/SanaaMAHMOUD，帮助中国国家羽毛球队赢得混合团体赛冠军。
2012年，黄雅琼参加2012亚洲青年羽毛球锦标赛，黄雅琼、于小含以1-2不敌申昇瓒、李绍希，获得女双亚军。
2013年，美国羽毛球黄金大奖赛，黄雅琼、王懿律以0-2不敌李晋熙、周凯华，获得混双亚军；加拿大羽毛球大奖赛，黄雅琼、于小含以2-1战胜埃菲耶·穆斯肯斯、塞莱娜·皮克，夺得女双冠军，也是职业生涯首个大奖赛冠军。
2014年，印度羽毛球黄金大奖赛，黄雅琼、王懿律以2-0战胜黄凯祥、陈清晨，获得混双冠军；澳门羽毛球公开赛，黄雅琼、钟倩欣以1-2不敌区冬妮、于小含，获得女双亚军。
2015年，法国羽毛球公开赛，黄雅琼、汤金华2-0战胜骆赢、骆羽，夺得女双冠军。
2016年，德国羽毛球公开赛，黄雅琼、汤金华以2-0战胜普缇塔、沙西丽，夺得女双冠军；澳大利亚羽毛球公开赛，黄雅琼、鲁恺以2-0战胜郑思维、陈清晨，获得混双冠军，这也是鲁恺、黄雅琼第二次拿到超级赛的混双冠军。
2017年，印度羽毛球公开赛，黄雅琼、鲁恺以2-1战胜陈清晨、郑思维，获得混双冠军；马来西亚羽毛球公开赛，黄雅琼、鲁恺以0-2不敌陈清晨、郑思维，获得混双亚军。
2018年，全英羽毛球公开赛，黄雅琼、郑思维以1-2不敌渡边勇大、东野有纱，获得混双亚军；马来西亚羽毛球公开赛，黄雅琼/郑思维以2-0战胜王懿律、黄东萍，夺得混双冠军；世界羽联年度颁奖盛典在广州举行，黄雅琼获得最佳女运动员奖。
2019年，巴塞尔世界羽毛球锦标赛，黄雅琼、郑思维以2-0战胜德差波/沙西丽，获得混双冠军；中国（福州）羽毛球公开赛，郑思维/黄雅琼以0-2不敌王懿律/黄东萍，获得混双亚军；同年12月9日，获得世界羽联年度最佳女运动员奖，继2018年获得最佳女运动员奖后再次蝉联这个奖项。
2020年，在全国羽毛球锦标赛混双项目中郑思维、黄雅琼以4比2战胜欧烜屹、黄东萍获得冠军。
2021年，在东京奥运会羽毛球混合双打决赛中，郑思维、黄雅琼获得银牌。
2019年5月28日，黄雅琼被聘任为衢州城市形象大使。
▪2020-01-19印尼羽毛球大师赛混双冠军（获奖）
▪2020-01-12马来西亚大师赛混双冠军（获奖）
▪2019苏迪曼杯世界羽毛球混合团体锦标赛冠军（获奖）
▪2019世界羽毛球锦标赛混双冠军（获奖）
▪2019马来西亚羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2019全英羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2019印尼羽毛球大师赛混双冠军（获奖）
▪2018世界羽毛球锦标赛混双冠军（获奖）
▪2018中国羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2018马来西亚羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2018中国（福州）羽毛球大师赛混双冠军（获奖）
▪2018法国羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2018丹麦羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2018日本羽毛球公开赛混双冠军（获奖）
▪2018亚运会羽毛球混双冠军（获奖）
▪2018印尼羽毛球大师赛混双冠军（获奖）
▪2017中国香港羽毛球超级赛混双冠军（获奖）
▪2017中国羽毛球首要超级赛混双冠军（获奖）
▪2017中国澳门羽毛球黄金大奖赛女双冠军（获奖）
▪2017韩国羽毛球超级赛女双冠军（获奖）
▪2017亚洲羽毛球锦标赛混双冠军（获奖）
▪2017新加坡羽毛球超级赛混双冠军（获奖）
▪2017印度羽毛球超级赛混双冠军（获奖）
▪2017全英羽毛球首要超级赛混双冠军（获奖）
▪2016澳大利亚羽毛球超级赛混双冠军（获奖）
▪2016印度羽毛球超级赛混双冠军（获奖）
▪2016德国羽毛球黄金大奖赛女双冠军（获奖）
▪2015法国羽毛球超级赛女双冠军（获奖）
▪2015瑞士羽毛球黄金大奖赛混双冠军（获奖）
▪2014中国羽毛球大师赛混双冠军（获奖）
▪2014马来西亚羽毛球黄金大奖赛混双冠军（获奖）
▪2014马来西亚羽毛球黄金大奖赛女双冠军（获奖）
▪2013中国澳门羽毛球黄金大奖赛混双冠军（获奖）
▪2013加拿大羽毛球大奖赛女双冠军（获奖）
▪2012世界青年羽毛球锦标赛混合团体冠军（获奖）
▪2011亚洲青年羽毛球锦标赛混合团体冠军（获奖）
▪2019世界羽联年度最佳运动员奖（获奖）
▪2019国际级运动健将（获奖）
▪2018世界羽联年度最佳运动员奖（获奖）
你很难想象黄雅琼这样一个斯文的女生在羽毛球的赛场上表现出有杀伤力的一面，而事实上，她也确实没有。混双比赛里，从没见她像其他运动员一样用呐喊声震慑对手。大多数时候，赛场上的黄雅琼都是冷静持重的，赛场下更是如此。（《ELLEMEN睿士》评）
乖巧的黄雅琼是个按部就班的人，但她的心态也越来越逐渐成熟，能够顶住赛场上的大风大浪，是一个慢慢完成自我成长与进化的运动员。（《羽毛球》杂志评）
