长期以来,中国书店对历代典籍、书刊进行了卓有成效的发掘和抢救。同时,还将这些记载着先贤智慧的珍贵文献进行科学、系统的整理和出版,使其化一为百、化一为千、为万。中国书店早在20世纪50年代就开始进行古籍的复制出版等古籍整理工作,“文革”中曾一度中止。1979年,中国书店再度恢复古籍复制出版整理工作。1988年,经新闻出版署批准,中国书店出版社正式纳入出版社管理系列,出版前缀号为ISBN7-80568。经过几代人的辛勤努力,中国书店先后整理出版各类新印古籍和研究、介绍传统文化的图书1600多种。并且已经形成以线装新印古籍为特色、以影印复制为优势,在古典文学典籍的整理、北京传统文化研究以及版本目录学等方面重点发展的出版格局。
1979年,中国书店出版社恢复出版工作。中国书店出版社是一家承担古籍和文史类图书出版的文化类综合出版企业。经过三十余年的发展,形成了以线装新印古籍为特色、以文学、历史、哲学和传统艺术图书出版为优势的出版格局,主要出版古籍整理项目、书法艺术和社科文史类图书。
自1979年至1997年底,中国书店出版社共出版图书1650余种。其中《北京通史》荣获中宣部“五个一工程奖”,《海王村古籍丛刊》、《稀见中国地方志汇刊》被列为国家“八五”重点图书项目。《中国历史大洪水》、《中国大洪水》以及《中国大书典》、《孔子文化大典》、《异史》、《十竹斋书画谱》、《中国古代建筑辞典》等图书多次获奖,受到社会各界的充分肯定。近些年来,中国书店出版社在北京地方古代典籍文献的整理出版上倾注了大量的力量,承担了《北京旧志汇刊》、《北京方志提要》、《中国古代琴学丛书》等古籍整理项目,显示出中国书店出版社对传统文化的继承和传播方面所做的积极贡献。
1956年对资本主义工商业进行社会主义改造以后,北京的私营古旧书店并入中国书店。根据古籍流传日益减少的情况,从1978年起,采用古老的木版刷印和胶版影印等方法,复制出版古旧书刊309种,印行690多万部、册,其中《龙溪精舍丛书》、《清儒学案》、《词谱》、《四体大字典》等有较高的学术研究价值和实用参考价值。