周如砥生于嘉靖二十九年(1550年)。幼年丧父,其母亦随之“殉节”。其伯父、伯母省吃俭用,供其读书。明万历十七年(1589年),考中进士,授庶吉士检讨,后升任国子监祭酒。在任职期间,他严于律己,礼贤下士,特别注意培养人才,奖掖后进,有“时天下士多出其门”之誉。他的文章在当时也颇负盛名,《山东通志》称“如砥文章名天下”。有著作《青黎馆集》传诵于世。
他年老归里后,谢绝官场交往,但关心人民疾苦,常评议地方利弊,曾呈请皇帝减免百姓的额外赋税。
周如砥于万历四十二年撰写了《重修鹤山遇真庵碑》,对鹤山之景观及遇真庵之历史皆有记述,为研究崂山道教提供了宝贵资料。此外,还写有《黄石草堂》、《法海寺》、《白云庵》等游崂诗篇。