台湾阳明交通大学源头为1896年创立于上海的南洋公学,1912年改名交通部上海工业专门学校,1921年改称交通大学,1937年改隶教育部,称国立交通大学。两岸分治后,上海原址改组为西安交通大学和上海交通大学。1958年,交通大学在台复校,校址选定新竹市,成立交通大学电子研究所,1967年改制为交通大学工学院,1979年恢复交通大学校名。2020年7月,台湾教育主管部门同意交通大学与阳明大学合并,并在8月12日复函两校于2021年2月1日起合并为“阳明交通大学”。2021年2月1日,台湾交通大学与台湾阳明大学正式合并为台湾阳明交通大学。